男主角吴居蓝和女主角陆漓两人最后在一起了。在第2部结局的时候这两个人双双跳海,但是结局并没有显示两人是生是死,所以有人猜测他们跳入海里之后昏迷了,吴居蓝被沈螺救了过来,她用真爱之吻将灵珠唤了出来,然后救了吴居蓝。
吴居蓝因为得到了灵珠所以寿命被延续了千年最后回归了大海。这部剧是以喜剧收尾的吴居蓝和陆漓两人有情人终成眷属,不过这部剧和第一部相比,除了主角的名字没变其他的人名几乎都发生了改变,所以这部剧和上一部几乎没有任何牵连。
这部剧主要讲的是大唐盛世,当时的造船业非常发达女主角女扮男装进入了船厂,她想要在这里大展身手实现远洋航行的梦想,在这里她遇到了带着神秘任务而来的鲛人族的王子吴居蓝,两个人也算是不打不相识从最开始的两看相厌一直到迸发出爱情的火花,但是在爱情的背后隐藏着更深的阴谋,陆漓也在爱情和亲情之间感觉到了选择的痛苦,两个人的爱情最终化解了仇恨,让人族和鲛人族最终和平共处。
化解了两族的纷争之后两人还是结婚了,通过剧中的童话故事可以得知,有人给金发人鱼生了孩子,所以根据这个童话故事的结尾也能推测出这部剧的结局是喜剧的结局。